研究报告

盐胁迫条件下不同基因型籼稻表达谱芯片数据分析  

刘慰华1* , 吕宏斌1* , 钱敏2 , 黄格1 , 郑爱清1 , 崔永祯1 , 赵红1 , 朱振华1 , 丁明亮1
1 云南省农业科学院粮食作物研究所, 昆明, 650205; 2 云南省农业科学院农业经济与信息研究所, 昆明, 650205
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2018年07月27日    接受日期: 2018年09月05日    发表日期: 2019年08月15日
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摘要

盐胁迫是制约水稻产量的主要逆境因素之一,特别是对幼穗分化期的水稻产量影响尤其显著。本研究以水稻 Affymetrix 表达谱芯片的数据为例,应用生物信息学方法进行数据挖掘,研究幼穗分化期籼稻耐盐品种 FL478 和感盐品种 IR29 在盐胁迫处理条件下的基因差异表达情况。芯片数据分析共筛选到差异倍数在 2倍及以上的基因 257 个,以 IR29 为参照,FL478 中上调基因 138 个,下调基因 119 个,主要涉及到 β-丙氨酸生物合成、木糖降解、脂肪酸 氧化等生物学过程。通过这些数据挖掘,初步探讨籼稻抗盐胁迫的表达调控机理。本研究为进一步揭示籼稻耐盐性分子机制提供了科学依据。

关键词
盐胁迫;基因芯片;数据挖掘

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《分子植物育种》印刷版
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